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阿里巴巴的總部位於杭州，外觀看起來就像矽谷的企業。這裡和大部分的中國網路公司一樣，多數資深管理人員都曾在海外留學或工作。但由於阿里巴巴位於中國，它無法像西方企業那樣營運。
中國有許多小企業家，但金融系統並不發達。馬雲於2004年建立線上付款系統「支付寶」，現在支付寶在全球擁有4.7億使用者。他還創辦了阿里貸款服務，他並不提供貸款，而是與銀行合作；銀行通常不知道小借款人的信用狀況，馬雲則有大量資料可以用來判斷小企業的信用。
阿里巴巴目前有幾個障礙。其一，中國網路市場競爭激烈而且變化極快；其二，人才短缺，優秀工程師和管理人員的薪資快速上升；其三，阿里巴巴的主要服務是免費的，馬雲相信規模總有一天會帶來益處，但投資人不可能等一輩子，因此阿里巴巴也承諾會在明年發放特別股利。
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