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許多人認為南海是海底擴張的產物，此計畫及其他機構的研究計畫，應有助解答南海究竟是如何生成、其海底有多少部分屬於自中洋脊噴出的玄武岩海床、有多少屬於恰巧處於海平面以下的陸塊岩石。
該計畫的第二部分為研究沉積作用和古代氣候，即使科學家再怎麼否認，這都會是石油和天然氣工業最感興趣的部分。過去3000多萬年來，湄公河、紅河、珠江三角洲將約14000兆的沉積物送入南海，那可以困住石油和天然氣，也保存了大量的氣溫、雨量和海平面資料。
第三部分則是探索南海生物，尤其是深海生物。科學家會研究微生物的碳封存、海底熱泉和火山口附近的生物，並長期測量洋流以及南海內部、南海與太平洋的養分及浮遊生物交流。
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